{"id":2221,"date":"2015-07-09T23:46:37","date_gmt":"2015-07-09T20:46:37","guid":{"rendered":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/?p=2221"},"modified":"2015-07-09T23:46:37","modified_gmt":"2015-07-09T20:46:37","slug":"atalarimizdan-gelmeyen-cok-sayida-yeni-yabanci-gen-tespit-edildi","status":"publish","type":"post","link":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/2015\/07\/atalarimizdan-gelmeyen-cok-sayida-yeni-yabanci-gen-tespit-edildi\/","title":{"rendered":"Atalar\u0131m\u0131zdan gelmeyen \u00e7ok say\u0131da yeni yabanc\u0131 gen tespit edildi"},"content":{"rendered":"<p>&nbsp;<\/p>\n<p>A\u00e7\u0131k kaynak Genome Biology&#8217;de yay\u0131mlanan yeni bir ara\u015ft\u0131rmaya g\u00f6re insanlar\u0131n da dahil oldu\u011fu bir \u00e7ok hayvan birlikte ya\u015fad\u0131klar\u0131 mikroorganizmalardan \u00f6nemli fonksiyonlara sahip yabanc\u0131 genler toplad\u0131\u011f\u0131 anla\u015f\u0131ld\u0131. Ara\u015ft\u0131rma, havanlarda evrimin temellerinin atalardan aktar\u0131lan genlere ba\u011fl\u0131 oldu\u011fu \u015feklindeki geleneksel d\u00fc\u015f\u00fcnceye meydan okuyor, ayr\u0131ca ara\u015ft\u0131rmada \u00f6nerilen ilgin\u00e7 fikirlerden birisi de baz\u0131 soy a\u011fa\u00e7lar\u0131nda bu s\u00fcrecin halen devam etti\u011fi.<\/p>\n<p>Ayn\u0131 ortamda ya\u015fayan organizmalar aras\u0131ndaki gen transferine yatay gen transferi ( horizontal gene transfer &#8211; HGT ) olarak bilinmektedir. Tek h\u00fccreli organizmalarda s\u0131k rastlanan bir olayd\u0131r ve bakterilerin antibiyotikler kar\u015f\u0131s\u0131nda h\u0131zla mutasyon ge\u00e7irmesi fenomenine a\u00e7\u0131klama getirilmesini sa\u011flam\u0131\u015ft\u0131r.<\/p>\n<p>HGT baz\u0131 hayvanlar\u0131n evrilme s\u00fcrecinde \u00e7ok \u00f6nemli roller oynam\u0131\u015ft\u0131r, mikroorganizmalardan ve bitkilerden gen toplayan yuvarlak solucanlar da ( nematode worms ) buna d\u00e2hildir, baz\u0131 b\u00f6cekler kahve \u00e7ekirdeklerini sindirmek i\u00e7in ihtiyac\u0131 olan enzimi \u00fcreten genleri baz\u0131 bakterilerden elde etmi\u015ftir.<\/p>\n<p>Fakat HGT&#8217;nin insan gibi genleri do\u011frudan atalar\u0131ndan alan karma\u015f\u0131k hayvanlarda ger\u00e7ekle\u015fmesi uzun zamand\u0131r geni\u015f bir tart\u0131\u015fma konusu olmu\u015ftur. Cambridge \u00dcniversitesinden ara\u015ft\u0131rman\u0131n lider yazar\u0131 Alastair Crisp, &#8220;Y\u00fczlerce aktif yabanc\u0131 genlerdeki art\u0131\u015f g\u00f6z \u00f6n\u00fcne al\u0131n\u0131rsa, insanlar\u0131n da d\u00e2hil oldu\u011fu hayvanlar aras\u0131nda yatay gen transferinin (horizontal gene transfer &#8211; HGT ) ne kadar yayg\u0131n oldu\u011funu g\u00f6steren ilk \u00e7al\u0131\u015fma.<\/p>\n<p>S\u00fcrpriz olansa bu aktif genlerin ortaya \u00e7\u0131k\u0131\u015f\u0131 nadir olmaktan \u00e7ok uzak, g\u00f6r\u00fcn\u00fc\u015fe bak\u0131l\u0131rsa HGT bir\u00e7ok belki de b\u00fct\u00fcn hayvanlarda evrim s\u00fcrecinde \u00f6nemli roller oynam\u0131\u015f ve bu s\u00fcre\u00e7 halen devam etmekte. Bu da evrimi d\u00fc\u015f\u00fcnme \u015feklimizi tekrar g\u00f6zden ge\u00e7irmemiz anlam\u0131na gelmektedir.&#8221; dedi.<\/p>\n<p>Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar 12 Drosophila yada meyve sine\u011fi, d\u00f6rt farkl\u0131 yuvarlak solucan t\u00fcr\u00fc ve insan dahil 10 farkl\u0131 primat t\u00fcr\u00fc \u00fczerinde incelemeler yapt\u0131. Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar inceleme yapt\u0131klar\u0131 canl\u0131lardaki genlerin di\u011fer t\u00fcrlerle benzerliklerini hesaplad\u0131, hesaplamalara g\u00f6re incelenen genlerin \u00e7o\u011fu yabanc\u0131.<\/p>\n<p>Di\u011fer bir grup t\u00fcrle yapt\u0131klar\u0131 kar\u015f\u0131la\u015ft\u0131rmalar sayesinde ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar genlerin ne kadar \u00f6nce elde edildi\u011fini hesaplamay\u0131 ba\u015fard\u0131. Aralar\u0131nda ABO kan grup genlerinin de bulundu\u011fu bir\u00e7ok genin omurgal\u0131lar taraf\u0131ndan yatay gen transferi yoluyla al\u0131nd\u0131\u011f\u0131n\u0131 tespit edildi. Geriye kalan genlerin b\u00fcy\u00fck k\u0131sm\u0131n\u0131n metabolizma i\u00e7inde enzimlerle ilgili oldu\u011fu tespit edildi.<\/p>\n<p>\u0130nsanlarda HGT yoluyla elde edilmi\u015f daha \u00f6nceden rapor edilen 17 ve ek olarak insan genomunda daha \u00f6nce rapor edilmeyen 128 yabanc\u0131 gen tespit edildi. Bu genlerin baz\u0131lar\u0131, ya\u011f asitlerini par\u00e7alama ve glycolipid olu\u015fumundan sorumlu lipit ( lipid ) metabolizmas\u0131yla ba\u011flant\u0131l\u0131 oldu\u011fu anla\u015f\u0131ld\u0131. Di\u011fer genler ise ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k sistemi cevaplar\u0131yla ilgili, bunlar\u0131n aras\u0131nda iltihapl\u0131 cevap verme, ba\u011f\u0131\u015f\u0131k h\u00fccre sinyalleri, antimikrobiyal cevaplarla ilgili, di\u011fer baz\u0131 genler ise, protein d\u00fczenleme, oksit giderici faaliyetler gibi amino asit metabolizmas\u0131yla ilgili.<\/p>\n<p>Ekip gen transferinin geldi\u011fi organizma klas\u0131n\u0131 da tan\u0131mlam\u0131\u015f olabilir. Elde edilen bilgilere g\u00f6re bunlar bakteriler ve protistler incelenen b\u00fct\u00fcn t\u00fcrlerde ortak donorlar oldu\u011fu anla\u015f\u0131ld\u0131. Ekip ayr\u0131ca vir\u00fcslerden gelen yatay gen transferi tespit etti, bu genler primatlarda 50 yabanc\u0131 gene kadar \u00e7\u0131k\u0131yor. Tespit edilen baz\u0131 genlerin ise mantarlardan geldi\u011fi anla\u015f\u0131ld\u0131.<\/p>\n<p>&#8220;Protistler (Latince: Protista, bazen Latince: Protoctista), ayr\u0131\u015f\u0131k (heterojen) bir canl\u0131 grubudur ve hayvan, bitki ya da mantar olarak de\u011ferlendirilemeyen \u00f6karyot canl\u0131lardan olu\u015fur.&#8221;<\/p>\n<p>Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lara g\u00f6re yapt\u0131klar\u0131 \u00e7al\u0131\u015fma muhtemelen karma\u015f\u0131k \u00e7ok h\u00fccreli organizmalar aras\u0131ndaki yatay gen transferinin boyutlar\u0131n\u0131 hafife almaktad\u0131r, \u00fcstelik buna \u00f6rnek olabilecek baz\u0131 ev sahibi parazit ili\u015fkileri \u015fimdiden bilinmekte.<\/p>\n<p>Ara\u015ft\u0131rma gen dizileme i\u015fleminde kullan\u0131labilecek potansiyel uygulama alanlar\u0131 a\u00e7\u0131yor. Genom projeleri bakteri sonu\u00e7lar\u0131n\u0131 bula\u015fma varsay\u0131m\u0131ndan yola \u00e7\u0131karak sonu\u00e7lardan siliyordu. Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lara g\u00f6re potansiyel bakteri bula\u015fma ihtimaline kar\u015f\u0131 g\u00f6zlemenin yap\u0131lmas\u0131n\u0131n gerekli olmas\u0131 yan\u0131nda bu genlerin yatay gen transferiyle gelmi\u015f olma ihtimalinin de g\u00f6z \u00f6n\u00fcnde bulundurulmas\u0131 da \u00e7ok \u00f6nemli.<\/p>\n<p><strong>Kaynak:<\/strong> Bilim Nedir?<strong>\u00a0<\/strong><\/p>\n<p><strong>Ara\u015ft\u0131rma referans\u0131:<\/strong><\/p>\n<p>Alastair Crisp, Chiara Boschetti, Malcolm Perry, Alan Tunnacliffe, Gos Micklem. Expression of multiple horizontally acquired genes is a hallmark of both vertebrate and invertebrate genomes. Genome Biology, 2015; 16 (1) DOI: 10.1186\/s13059-015-0607-3<\/p>\n<p>Sciencedaily<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>&nbsp; A\u00e7\u0131k kaynak Genome Biology&#8217;de yay\u0131mlanan yeni bir ara\u015ft\u0131rmaya g\u00f6re insanlar\u0131n da dahil oldu\u011fu bir \u00e7ok hayvan birlikte ya\u015fad\u0131klar\u0131 mikroorganizmalardan \u00f6nemli fonksiyonlara sahip yabanc\u0131 genler toplad\u0131\u011f\u0131 anla\u015f\u0131ld\u0131. Ara\u015ft\u0131rma, havanlarda evrimin temellerinin atalardan aktar\u0131lan genlere ba\u011fl\u0131 oldu\u011fu \u015feklindeki geleneksel d\u00fc\u015f\u00fcnceye meydan okuyor, ayr\u0131ca ara\u015ft\u0131rmada \u00f6nerilen ilgin\u00e7 fikirlerden birisi de baz\u0131 soy a\u011fa\u00e7lar\u0131nda bu s\u00fcrecin halen devam &hellip;<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":2222,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[11],"tags":[],"class_list":["post-2221","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-bilimsel"],"_links":{"self":[{"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2221","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2221"}],"version-history":[{"count":1,"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2221\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2223,"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2221\/revisions\/2223"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/media\/2222"}],"wp:attachment":[{"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2221"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2221"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"http:\/\/kosmosmacerasi.com\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2221"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}